A som i Alien är en bok som bryter mot flera normer och väcker tankar kring miljöfrågor och jordens resurser. 

Efter sommarlovet verkar inget vara sig likt i Sopperås. Läraren Britt är borta, hon är ersatt av magister Alf, och den enda som verkar minnas henne är Erik.

Maja, den nyinflyttade flickan, visar sig ha viktiga ledtrådar och tillsammans börjar de nysta i det märkliga försvinnandet. I byn finns även Galen-Per, den konstiga ingenjören, som påstår sig ha bevis för att utomjordingar finns.

När Sopperås hotas av nedläggning får Erik och Maja oväntad hjälp av Galen-Per som menar att något stort är på gång, något som kanske har med den nya underlige magistern att göra.