Akiran tarina jatkuu. Salaisen sotilassatelliitin Solin helvetillinen lasertykitys on tehnyt Tetsuosta yksikätisen. Kaneda ja Kay välttyvät niukin naukin jäätymästä kuoliaiksi salaisen tukikohdan elvytyshuoneessa ja pelastavat vahingossa mystisen pojan, jonka kämmenselkään on polttomerkitty numero 28. Paluun tehnyt AKIRA saa kannoilleen eversti Nezun sissijoukot ja eliittiarmeijan. Kuka tulee hallitsemaan Akiraa?