Neo-Tokio on tulvien ja järistysten vallassa. Sen kiviraunioista nousseen suuren keisarikunnan kiihkoilevat asukit palvovat ja pelkäävät johtajaansa AKIRAA, suunnattomat psyykkiset voimat omaavaa arvoituksellista lapsikeisaria. Akiran hullun pääministerin Tetsuon voimat ovat karkaamassa hallinnasta ja saamassa hirviömäiset mittasuhteet.

Lady Miyokon vallankumouksellinen armeija päättää toimia ja hyökätä Tetsuota vastaan. Tetsuon perässä ovat myös Yhdysvaltain merijalkaväki sekä Kanedan taistoon lietsoma moottoripyöräjengi. Tämä on heidän viimeinen mahdollisuutensa ennen kuin Tetsuosta tulee toinen Akira - minuutensa menettänyt voiman välikappale.