Australien har blivit invaderat. Ett gäng tonåringar har bildat en gerillagrupp och lever gömda i en dalgång. De bestämmer sina egna regler, skyddar det som är deras, kämpar för sin överlevnad i en värld som är för alltid förändrad. I den skrämmande verkligheten fördjupas kärleken mellan Ellie och Lee. Men Ellie skräms av den kallblodighet hon ser hos Lee; det moraliska dilemmat gör sig hela tiden påmint. Kan man älska någon som har dödat? När natten är som mörkast är andra delen i serien om Ellie. Den träffar rakt in i det undermedvetnas frågor om rätt och orätt, liv och död, kärlek och ondska.