Den rika fru Citze är gift med Malmös borgmästare Jörgen Kock. I hemlighet går hon till den kloka Barbara i Snapperups straede och får hemliga pulver och örter. Barbaras dotter Mette och pojken Jakob som är pebling i Malmö latinskola lär känna varandra. Men vad gör de ensamma på Sankt Petri kyrkogård mitt i natten?
Året är 1524. Kungarna Fredrik I och Gustav Vasa träffas i Malmö. De har möten på Helgeandsklostret och håller fest på Myntergården. Kan Danmark och Sveriges enas politiskt?
Samtidigt börjar en ny religiös lära att ta form. Vågar Jakob stå emot prästen Claus Mortensen som har börjat predika Luthers teser och vill kasta ut alla klosterbröderna?