El segon volum de l'Atles Manual de la Història de Catalunya comprèn el període que va entre els comtes reis del segle XII i fins a meitat del segle XVI amb el Tractat dels Pirineus. volum recull més d'un miler de mapes, la gran majoria completament inèdits. Completen els mapes uns breus textos i uns gràfics sobre cada tema. L'estructura de l'obra segueix una distribució a doble pàgina, cadascuna presentada de manera independent. Compta amb una relació de les fonts utilitzades per a la confecció dels mapes, una bibliografia general i un índex toponímic.