Kasviplanktontutkimuksessa käsiteltiin sekä pitkän ajan seurannan että yhden vuoden intensiivitutkimuksen tuloksia ja arvioitiin, miten lajisto ja biomassa ilmentävät veden laadussa tapahtuneita muutoksia. Samalla pyrittiin myös selvittämään soveltuuko Pyhäjärven kasviplanktonyhteisö vesipuitedirektiivin mukaiseen järven ekologisen tilan arviointiin. Saatuja tuloksia voidaan käyttää hyväksi tämän luonnonarvoiltaan arvokkaan järven vesistöseurannassa ja vesiensuojelupäätöksiä tehtäessä.