Minato Sahashi, un giovane buono a nulla, incontra una ragazza bellissima di nome Musubi. Senza rendersene conto, Minato sarà presto coinvolto nel progetto "Sekirei", in cui sexy combattenti sono costrette a sfidarsi in surreali battaglie all'ultimo sangue. Minato capirà così il suo destino e ciò che lo lega alla bella Musubi.