Huippuagentti Jason Bourne joutuu hirvittävän valinnan eteen.

Jason Bourne suorittaa tehtävää Lähi-idässä, kun pahamaineinen terroristi El Ghadan kaappaa hänet. Siepattuina ovat myös Bournen ystävä Soraya Moore ja tämän pieni tytär. Samaan aikaan Israelin ja Palestiinan välille on syntymässä historiallinen rauhansopimus, jonka solmimisessa Yhdysvaltain presidentillä on merkittävä rooli. Estääkseen sopimuksen toteutumisen El Ghadan pakottaa Bournen valitsemaan: Soraya ja tämän tytär pelastuvat vain, jos Bourne suostuu murhaamaan presidentin.