Ollaan maailmassa, jossa alkemiasta on tullut tabu ja sitä pidetään pahana. Atelier Yumia: The Alchemist of Memories & the Envisioned Land seuraa Yumia Liessfeldtin ja hänen kumppaneidensa seikkailuja, kun he yrittävät paljastaa totuuden kerran kukoistaneen Aldissian valtakunnan kaatumisesta. Yumian etsintä vie hänet raunioituneen mantereen halki ja menneisyytensä kohtaamisesta huolimatta hänen on luotava oma polkunsa, jos hän toivoo selvittävänsä Aladissin tuhonneen katastrofin mysteerit.