Nuori Hinetoshi on kamppailutaitojen harjoittaja, joka vaeltelee syrjäisillä seuduilla mausteita myyvän mestarinsa Nagerun kanssa.

Kun Nagerun korviin kantautuu huhu, että keisarin poika on sairastunut parantumattomaan kulkutautiin, hän kehittelee vitsaukseen lääkkeen ja päättää viedä sen tulevalle hallitsijalle. Hinetoshi sijoitetaan siksi aikaa Suuren rukouksen temppelin maineikkaaseen taistelukouluun, jossa hän tapaa itsensä kaltaisia nuoria: soturioppilaita, jotka haluavat tulla voittamattomiksi taistelijoiksi.

Kaikki ei kuitenkaan suju piirustusten mukaan. Hinetoshi joutuu keskelle temppeliä piinaavia ristiriitoja, valtataistelua ja poliittista peliä, jonka panoksena ovat temppelin tulevaisuus, koko keisarikunnan olemassaolo ja maailmankaikkeuden tasapaino - sekä Hinetoshin oma henkiriepu... FatalNinjan maaginen maailma on kiehtova sekoitus feodaaliajan Japania, itämaisia taistelutaitoja ja aasialaista filosofiaa.

Aleksi Delikouras on helsinkiläinen opiskelija, joka rakastaa kung fu -elokuvia ja harrastaa taistelulajeja. Kristina Delikouras on tekstuaalinen sekatyöläinen, joka on kiinnostunut taijista ja mietiskelystä. Aleksi Delikouraksen lyhytelokuvakäsikirjoituksiin perustuva FatalNinja - Soturioppilas on heidän esikoisteoksensa.