Sosiaali- ja terveysministeriö ohjaa hallinnonalansa virastoja ja laitoksia vuosittain laadituilla tulossopimuksilla, joissa sovitaan pidemmän ja lyhyemmän aikavälin tulostavoitteet ja voimavarat. Sosiaali- ja terveysministeriö seuraa tavoitteiden ja tuloksellisuuden toteutumista. Virastot ja laitokset raportoivat tulostavoitteiden toteutumisesta ja tuloksellisuudesta ministeriölle tilinpäätöksessä ja siihen kuuluvassa toimintakertomuksessa. Alustava palaute annetaan virastoille ja laitoksille vuoden 2006 tulossopimuksista kevään 2007 hallinnonalan tulosohjauspäivillä. Virallinen palaute annetaan ministeriön julkaisemina tilinpäätös- tai toimintakertomuskannanottona virastoille ja laitoksille 15.6.2007 mennessä. Kannanotot toimitetaan valtiovarainministeriölle, valtiontilintarkastajille, Valtiontalouden tarkastusvirastolle ja Valtiokonttorille.