Tähän ohjeistoon on koottu keskeisimmät käytössä olevat ja käyttöön soveltuvat biologiset menetelmät, joilla Suomen vesistöjen ekologista tilaa on perinteisesti tutkittu ja seurantatietoa tuotettu. Siihen on koottu myös kansaivälisenä yhteistyönä laadittuja vesibiologiaan ja ekotoksilogiaan liittyviä menetelmästandardeja.