Valtakunnallisia biodiversiteettiseurantoja ylläpitää seitsemän valtion laitosta: Helsingin yliopiston Luonnontieteellinen keskusmuseo, Maa- ja elintarviketalouden tutkimuskeskus, Merentutkimuslaitos, Metsähallitus, Metsäntutkimuslaitos, Riista- ja kalatalouden tutkimuslaitos, Suomen ympäristökeskus ja niiden lisäksi kolme muuta yhteisöä. Selvityksen mukaan meneillään on 57 valtakunnallista seurantahanketta. Niistä suuressa osassa aineisto kerätään vapaaehtoistyönä.