HI-virus on retrovirus, joka aiheuttaa ihmisissä immuunipuolustuksen asteittaisen heikkenemisen, ja johtaa lopulta AIDS:iin. Tässä työssä on tutkittu infektoituneilla henkilöillä sekä DNA rokotetuilla hiirillä esiintyvää vasta-ainetuotantoa HI-viruksen Nef, Rev ja Tat proteiineja kohtaan. Nämä proteiinit syntyvät ensimmäiseksi HI-viruksen tunkeuduttua soluun, joten niihin kohdistunut immuunivaste voi mahdollisesti estää viruksen leviämisen ympäri kehoa.

Lisäksi ko. proteiinien rakenne on HI-viruksen eri kannoissa säilynyt paremmin kuin esimerkiksi viruksen ulkopinnan proteiinien rakenne, joten rokottamalla saatu Nef, Rev tai Tat immuunivaste voi mahdollisesti suojata erilaisilta HI-viruksen alatyypeiltä. Siksi niiden käyttöä rokotteissa on viime aikoina alettu tutkia ympäri maailmaa.

Työssä kartoitettiin Nef, Rev ja Tat vasta-aineiden yleisyyttä suomalaisilla HIV-potilailla, sekä etsittiin proteiineista niitä alueita, joihin vasta-aineet tarttuvat. Nef proteiini todettiin kaikista voimakkaimmaksi vasta-ainepuolustuksen herättäjäksi. Lisäksi kustakin proteiinista löydettiin useita immunogeenisia alueita, joita voidaan hyödyntää tulevissa rokotekokeissa.

Työssä tutkittiin myös näiden proteiinien käyttömahdollisuuksia uusissa DNA-pohjaisissa rokotteissa. Nef aikaansai rokotetuissa hiirissä voimakkaimman immuunivasteen, myös Rev oli immunogeeninen, mutta Tat proteiini ei toiminut käytetyissä rokotepreparaatissa.